MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 chromosome

Total Repeats: 81470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013971	CGG	2	6	67	72	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897735
2	NC_013971	AG	3	6	138	143	50 %	0 %	50 %	0 %	292897735
3	NC_013971	CAG	2	6	146	151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897735
4	NC_013971	GCT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897735
5	NC_013971	TGT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897735
6	NC_013971	GTGG	2	8	302	309	0 %	25 %	75 %	0 %	292897735
7	NC_013971	GTG	3	9	369	377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897735
8	NC_013971	GCT	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897735
9	NC_013971	GAT	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897735
10	NC_013971	CTGT	2	8	609	616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013971	TCGA	2	8	817	824	25 %	25 %	25 %	25 %	292897736
12	NC_013971	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897736
13	NC_013971	GGT	2	6	861	866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897736
14	NC_013971	CCA	2	6	878	883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897736
15	NC_013971	CTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897736
16	NC_013971	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897736
17	NC_013971	GCA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897736
18	NC_013971	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897736
19	NC_013971	AGC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897736
20	NC_013971	CGT	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897736
21	NC_013971	TGA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897736
22	NC_013971	CGG	2	6	1394	1399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897737
23	NC_013971	CAG	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897737
24	NC_013971	TC	3	6	1447	1452	0 %	50 %	0 %	50 %	292897737
25	NC_013971	GCC	2	6	1455	1460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
26	NC_013971	CAGC	2	8	1461	1468	25 %	0 %	25 %	50 %	292897737
27	NC_013971	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292897737
28	NC_013971	CGC	2	6	1523	1528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
29	NC_013971	GC	3	6	1800	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	292897737
30	NC_013971	AGT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897737
31	NC_013971	ACC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897737
32	NC_013971	GCTG	2	8	1901	1908	0 %	25 %	50 %	25 %	292897737
33	NC_013971	TGC	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
34	NC_013971	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292897737
35	NC_013971	GCC	2	6	2142	2147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
36	NC_013971	GTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
37	NC_013971	GTG	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897737
38	NC_013971	CGCC	2	8	2369	2376	0 %	0 %	25 %	75 %	292897737
39	NC_013971	CCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
40	NC_013971	TCC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897737
41	NC_013971	GCC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
42	NC_013971	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897737
43	NC_013971	CAG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897737
44	NC_013971	GCT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
45	NC_013971	TGA	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897737
46	NC_013971	CCAGCC	2	12	2604	2615	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	292897737
47	NC_013971	TCA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897737
48	NC_013971	CCA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897737
49	NC_013971	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897737
50	NC_013971	A	6	6	2667	2672	100 %	0 %	0 %	0 %	292897737
51	NC_013971	ATC	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897737
52	NC_013971	TGT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897737
53	NC_013971	CAGG	2	8	2851	2858	25 %	0 %	50 %	25 %	292897737
54	NC_013971	CTG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
55	NC_013971	TCG	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
56	NC_013971	TCA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897737
57	NC_013971	GC	3	6	3156	3161	0 %	0 %	50 %	50 %	292897737
58	NC_013971	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897737
59	NC_013971	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897737
60	NC_013971	ATA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897737
61	NC_013971	TCG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897737
62	NC_013971	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897737
63	NC_013971	TGG	2	6	3406	3411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897737
64	NC_013971	TGT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897737
65	NC_013971	ATG	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013971	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897738
67	NC_013971	GCT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
68	NC_013971	GTTGCT	2	12	3635	3646	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	292897738
69	NC_013971	GA	3	6	3703	3708	50 %	0 %	50 %	0 %	292897738
70	NC_013971	ACC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897738
71	NC_013971	AGGC	2	8	3766	3773	25 %	0 %	50 %	25 %	292897738
72	NC_013971	GCTG	2	8	3800	3807	0 %	25 %	50 %	25 %	292897738
73	NC_013971	CTGA	2	8	3822	3829	25 %	25 %	25 %	25 %	292897738
74	NC_013971	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292897738
75	NC_013971	AGC	2	6	3887	3892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
76	NC_013971	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
77	NC_013971	CGTT	2	8	3949	3956	0 %	50 %	25 %	25 %	292897738
78	NC_013971	TGG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292897738
79	NC_013971	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
80	NC_013971	CCA	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897738
81	NC_013971	GCC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897738
82	NC_013971	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897738
83	NC_013971	CAG	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
84	NC_013971	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897738
85	NC_013971	ATC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292897738
86	NC_013971	CTTCG	2	10	4284	4293	0 %	40 %	20 %	40 %	292897738
87	NC_013971	CAG	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
88	NC_013971	GGCT	2	8	4333	4340	0 %	25 %	50 %	25 %	292897738
89	NC_013971	CGCGC	2	10	4392	4401	0 %	0 %	40 %	60 %	292897738
90	NC_013971	CGC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897738
91	NC_013971	CAG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
92	NC_013971	GCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
93	NC_013971	AGC	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
94	NC_013971	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
95	NC_013971	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897738
96	NC_013971	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
97	NC_013971	CTG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897738
98	NC_013971	GCG	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897738
99	NC_013971	TTG	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897738
100	NC_013971	CG	3	6	4826	4831	0 %	0 %	50 %	50 %	292897738
101	NC_013971	GAGG	2	8	4845	4852	25 %	0 %	75 %	0 %	292897738
102	NC_013971	CAG	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897738
103	NC_013971	TAA	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292897738
104	NC_013971	CCA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292897738
105	NC_013971	CTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
106	NC_013971	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292897739
107	NC_013971	GCCA	2	8	5025	5032	25 %	0 %	25 %	50 %	292897739
108	NC_013971	ACAG	2	8	5047	5054	50 %	0 %	25 %	25 %	292897739
109	NC_013971	GCTG	2	8	5062	5069	0 %	25 %	50 %	25 %	292897739
110	NC_013971	CAGC	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	292897739
111	NC_013971	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
112	NC_013971	CTG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
113	NC_013971	GTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
114	NC_013971	CAGC	2	8	5288	5295	25 %	0 %	25 %	50 %	292897739
115	NC_013971	GTGA	2	8	5373	5380	25 %	25 %	50 %	0 %	292897739
116	NC_013971	CGG	2	6	5383	5388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897739
117	NC_013971	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897739
118	NC_013971	TGC	4	12	5472	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
119	NC_013971	GGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292897739
120	NC_013971	TTG	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292897739
121	NC_013971	GCT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
122	NC_013971	AGC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
123	NC_013971	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
124	NC_013971	AT	3	6	5718	5723	50 %	50 %	0 %	0 %	292897739
125	NC_013971	GCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
126	NC_013971	CTG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
127	NC_013971	CTC	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292897739
128	NC_013971	GATTTT	2	12	5863	5874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	292897739
129	NC_013971	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292897739
130	NC_013971	CAG	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
131	NC_013971	CGC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292897739
132	NC_013971	AGC	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292897739
133	NC_013971	GGCC	2	8	6095	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	292897739
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396	NC_013971	A	7	7	19502	19508	100 %	0 %	0 %	0 %	292897742
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